Visual Studio y servidor FTP

Saludos lista,
Disculpen que escriba este asunto aquí pues entiendo que es algo aparte de
la temática del foro, pero aspiro que a alguno de Uds. les haya pasado algo
parecido y puedan orientarme en mi proceder:

Estoy desarrollando en ASP .NET sobre Visual Studio .NET 2003 (bajo Windows
XP) y las aplicaciones que hago luego las copio (copio toda la carpeta de la
aplicación) hacia un servidor (en la misma red) GNU/Linux Debian Etch con
Mono instalado mediante FTP (en este mismo servidor Debian instalé el
VSFTP). Debido a que copio toda la carpeta del proyecto, ésta se me crea con
algunas restricciones de permisos y privilegios de usuario y por
consiguiente al ejecutar una página web
http://serverlocal/carpeta-del-proyecto/WebForm1.aspx salen algunos errores
referente a que no hay privilegios suficientes para ejecutar toda la página,
ésto lo he solucionado primero ejecutando una página web php que corre un
script en Linux Debian y le da “permisos a toda la carpeta para todos los
usuarios” y ahí si funciona la página web ASPX.

Pero resulta tedioso tener que hacer todo este procedimiento cada vez que
hago un cambio en la aplicación. Además hace poco vi que alguien se conectó
vía FTP a un servidor web remoto mediante Visual Studio .NET 2005 y los
cambio que hacia en la aplicación únicamente los grababa como si fuese un
proyecto local y luego se veían reflejados en la página web en Internet.

Cómo podría hacer yo para trabajar de una manera parecida sin tener que
estar dando tantas vueltas para poder ejecutar las páginas aspx ¿?