proteccion de codigo

hola no se si es aqui donde me tengo que dirigir ya que en los foros como forosdelweb no me responden el caso es el siguiente uso php 5.3 y me han pedido desarrollar una aplicacion tipo cms de gestion escolar se tratara de software comercial el instituto para el que va dirigido el software esta de acuerdo en serlo pero no quiero entregarlo sin proteger el codigo por la web solo encuentro como proteger el codigo con javascript pero eso no tiene sentido porque el codigo que se veria seria html generado lo que yo quiero es ocultar o proteger el codigo no puedo usar incuve ya que necesito tenerlo instalado en el servidor tampoco puedo usar zend guard porque solo funciona con php 5.2 ademas de que es demasiado caro he probado con varios ofuscadores pero todos ellos producen errores en el funncionamiento del sistema ¿habria otro medio de proteger el codigo? quiza creando un binario con apache php y mi sistema? se que se puede hacer ya que otras compañias ofrecen editores que lo permiten gracias de ante mano por la ayuda